“九月政爭”之后，由于馬英九“當家鬧事”且動用情報機關以竊聽的方式獲得“政敵”的證據，因此聲望大跌，最低時支持率跌破10%，成為臺灣民主史上支持率最低的“總統”。

正因為馬英九和王金平的分裂，致使王金平在服貿議題上站在民進黨一邊，阻礙服貿的通過。在民進黨長達六個月的阻擋之后，馬英九祭出黨紀，要求全黨“立委”必須支持服貿，強行推動過關。正是這樣的強力推動，點燃了3月份“太陽花”學運的導火索。馬英九因為發動“九月政爭”失去了王金平的配合，進而失去了對“立法院”的控制，造成了“太陽花”學運的爆發。

“馬英九下不下臺，辭不辭職是國民黨的事，但是不管國民黨誰上臺，都不能再用黨紀的方式綁架自己在國會的黨員。”選舉結果揭曉之后，“太陽花”學運領袖林飛帆如此表示。

“太陽花”學運出現之后，臺灣社會掀起一股“反中”“仇中”“反自由貿易”“反全球化”的思潮，在這種大背景之下，連勝文等“官二代”成為選舉中特別被檢視的對象。馬英九實施六年的兩岸開放政策也被徹底扣上了“親中賣臺”的紅帽子，兩岸制度層面的經濟交流也因此被斬斷。

“從根本上說，國民黨的潰敗就是因為沒有給臺灣一個方向”，臺灣大學政治系教授張亞中對《鳳凰周刊》記者表示，“民進黨追求臺灣主體性、追求臺灣終極獨立的兩岸路線臺灣人是聽得懂的，馬英九的不統不獨不武這種論調臺灣人是聽不懂的，在政治上馬英九模模糊糊，不敢邁出關鍵的一步，臺灣人自然就會擔心兩岸過多的經濟交流就會被大陸‘綁死’。馬英九執政六年，連陳水扁修改后的教材都不敢改回來，臺灣年輕人必然就跟著民進黨的論述走了”。

群雄并起，末路已至

對于國民黨此次選舉的大敗，馬英九至少一年前就已經有所預期。

去年11月10日，國民黨第十九次“全國”代表大會在臺中舉行，記者在現場觀察到至少五百座拒馬和蛇龍圍繞在會場周邊，場外抗議民眾在馬英九走進會場時集體丟鞋表示抗議。有本港媒體評論稱：“當時的現場氣氛肅殺到好像回到戒嚴時代，國民黨“全國”代表大會已經進行了十九屆，沒有一次像今年這么狼狽。”

在這場全代會上，因“九月政爭”支持度跌至個位數的馬英九提出修改黨章的議案，要求“總統”身兼黨主席。雖然有不少基層黨員當場嗆聲表示抗議，但在這些反對聲音被保安人員強行架出場外后，國民黨依舊通過修正案，保證馬英九即使在一年后的“九合一”選舉中大敗，也不必擔心失去黨主席職務。

11月29日，當“九合一”選舉票數尚未開完，但國民黨敗局已定的時候，臺“行政院長”江宜樺宣布辭職“承擔政治責任”。隨即12月2日“行政院”所有部長宣布總辭。此外，國民黨秘書長曾永權也宣布辭職。而馬英九在當晚的表態中，表示自己要對敗選的責任“一肩扛起”，但并未表示辭職。

臺灣歷次選舉中，無論國民黨還是民進黨，黨主席對黨內提名權、選舉策略都有極大的發言權，也是選舉結果的第一負責人。歷次選舉，不論國民黨、民進黨敗選，黨主席都是第一時間辭職。“行政院長”因地方選舉失敗而承擔“政治責任”而下臺尚屬首次。而且，實際上江宜樺本既不屬于國民黨高層，對此次選舉也并未參與操盤，對國民黨的潰敗，江宜樺并無任何法律或道義上的“政治責任”。

民進黨前主席許信良表示：“這次‘九合一’選舉，國民黨大敗讓馬英九輸掉了太多的權力，馬英九權力越小，他就會抓得更緊。”同樣，臺灣資深媒體人陳文茜則表示：“我對曾永權太熟了，他除了上廁所不用向馬英九報告，其他事情百分百聽從馬英九，曾永權不應該為敗選負責。”

選舉結束第二天，臺灣親藍媒體《聯合報》曾引用國民黨某高層的話說，馬英九將辭去黨主席的職位，“對職位絕不戀棧”，但國民黨發言人陳以信隨即否定這一說法，“雖然馬英九對個人職務并不戀棧，但是現在是黨內最需要穩定的時刻”。

實際上，由于馬英九去年在黨章中加入了“總統必然兼任黨主席”的條款，所以即便馬英九辭職負責，也需要再開一次國民黨全代會，將黨章修改才能辭職。

但在選舉過后第三天，情況發生了變化。12月2日舉辦的中山會報上，馬英九表態要辭去黨主席的職務，并在第二天的國民黨中常會上正式公布。

馬英九最終做下辭職的決定和社會輿論的逼宮有關。開票當晚，馬英九夫人周美青一夜沒睡，看完了所有電視臺的政論節目。在當天的節目中，所有名嘴幾乎全部將國民黨敗選的原因歸咎于馬英九執政不力。據臺灣媒體報道，讓馬英九決定辭職的最后一根稻草，就是周美青的意見。

此外，被馬英九視為“國師”、幾乎對其言聽計從的著名律師陳長文，也在臺灣媒體上投書，要求馬英九不僅辭去黨主席，干脆連“總統”一起辭掉。“2016年民進黨上臺幾成定局，今天到2016年的一年半時間馬英九注定推不動任何政策，為了臺灣未來一年多不再空轉，請馬英九辭去‘總統’，提前大選。”

在辭職信中，馬英九表示：“雖然我個人將在明天正式卸下黨主席的職務，但對中國國民黨而言，這不會是停頓，而是一個新的開始。我們沒有贏得這次戰役，但我們不能失去人民對國民黨的信任，國民黨永遠不會被打倒。”

按照國民黨的計劃，馬英九辭職之后將由某位副主席擔任代理黨主席，之后最早在2015年1月進行大選。由于2016年“總統”大選的黨內提名將在3月份進行，臺灣又有政黨主席“御駕親征”的政治傳統，哪位國民黨副主席接班不僅牽扯到2016年大選動向，也牽扯到未來兩岸關系的具體走向。

目前，國民黨內總共有7位副主席，依照排序分別是吳敦義、曾永權、洪秀柱、黃敏慧、朱立倫、胡志強和郝龍斌。

按照國民黨黨章，副“總統”吳敦義將成為代理黨主席的第一人選，從“立委”到“行政院長”再到副“總統”，雖然吳敦義因多次失言在臺灣民間聲望極差，但對馬英九十分尊崇，因此成為國民黨內馬英九最為信任的接班人。而國民黨內部呼聲最高的，則是保住國民黨“六都”執政唯一血脈的新北市長朱立倫。

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